如果形态异常的精子超过70%,特别是妻子有习惯性流产时,就应该考虑进行染色体核型检查,男方很可能具有染色体异常,需要排除这种可能性。如果异常精子少于70%,那么,也许是精索静脉曲张、职业或环境接触毒物、放射线、微波、服用药物、感染及应激等因素影响了睾丸生精过程。应该分析和寻找这些具有毒性作用的因素,如果存在这些因素,则应对症治疗或尽量改变这种状况,去除不利影响。至于附性腺感染时,精子形态在光学显微镜下多无特殊改变。有人研究过前列腺炎患者后发现,已有子女而因性功能问题来就诊者的精子形态正常,因不育来就诊者的精子形态与其他无炎症者也无显著区别。
精子形态异常时,因为头过大或其他形态异常不利于穿透宫颈粘液所形成的微小通道。宫颈粘液中常可见到头特别小的精子,多数因为无顶体存在。
如果畸形精子症找不出任何明确原因时,可以诊断为特发性畸形精子症,它实质上是一种原因不明的睾丸生精障碍。可以采用五子衍宗丸并随症加减的中医药治疗方法促进生精作用。