习惯性早期流产还与黄体功能不全、甲状腺功能减退、子宫畸形、子宫腔粘连、子宫肌瘤等有关。习惯性晚期流产最常见的原因是子宫颈内口松弛，可因先天性发育异常，也可因分娩、刮宫或子宫颈手术造成。另外，梅毒感染也可导致习惯性晚期流产，这种流产的胎儿都是死胎。
患习惯性流产的妇女在前次流产后，下次妊娠前，应与丈夫一起到医院进行详细的检查，找出病因，然后针对病因进行治疗。
因黄体功能不全、甲状腺功能减退等疾患引起的可给药物治疗，因子宫畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连引起的可行手术治疗。如夫妇双方之一有染色体异常者，胎儿发生染色体异常的可能性极大，即使妊娠后不发生流产而足月分娩，娩出之胎儿畸形发生率也比较高。
