阴道粘膜中最基础的细胞为底层中的内基底细胞,形小而圆,胞浆染成深蓝色,胞核大而松,胞浆边缘与胞核直径之比为1:1。最成熟的细胞为表层中的角化细胞,形大而方为多角形,胞浆色红,胞核小而致密,胞浆边缘与胞核直径之比为20:1。实验室检查根据阴道脱落细胞涂片中角化细胞所占百分率,可算出角化指数(CI);按表层细胞致密核所占百分率,可算出致密核指数(KI);按底层、中层、表层细胞在总脱落细胞中分别所占百分率,可算出成熟指数(MI)。临床上常根据上述指数估计体内雌激素的水平。
此外,阴道尚有自净作用,这是因为阴道粘膜受雌激素的作用合成糖原,此糖原经乳酸杆菌分解后产生乳酸,使阴道呈酸性(PH约为4-5),部分抑制细菌生长。